In "My Aquarium 2" kun je zoetwatervissen, zoutwatervissen, diepzeevissen en andere zeedieren samen in één aquarium zetten om ze te observeren (ook al zouden de dieren in het echt niet samen kunnen leven). Je kunt aquaria ook uitwisselen met Wii-vrienden.

Je kunt het aquarium versieren met rotsen, zeewier, drijfhout en nog veel meer. Je kunt het glas zelfs decoreren of de configuratie van de belichting wijzigen.

Je kunt bijvoorbeeld een aquarium naar een Wii-vriend sturen en de feestdag instellen op zijn verjaardag, zodat de vissen een speciale dans uitvoeren als je Wii-vriend jarig is!